Protein–RNA interactions for Protein: P10451

SPP1, Osteopontin, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPP1P10451 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPP1P10451 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPP1P10451 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPP1P10451 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SPP1P10451 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPP1P10451 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPP1P10451 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPP1P10451 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPP1P10451 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPP1P10451 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPP1P10451 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPP1P10451 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SPP1P10451 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SPP1P10451 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SPP1P10451 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPP1P10451 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPP1P10451 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPP1P10451 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPP1P10451 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPP1P10451 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPP1P10451 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPP1P10451 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPP1P10451 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPP1P10451 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPP1P10451 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPP1P10451 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPP1P10451 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPP1P10451 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPP1P10451 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPP1P10451 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPP1P10451 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPP1P10451 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPP1P10451 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPP1P10451 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPP1P10451 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPP1P10451 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPP1P10451 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPP1P10451 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPP1P10451 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPP1P10451 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPP1P10451 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPP1P10451 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPP1P10451 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPP1P10451 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPP1P10451 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPP1P10451 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPP1P10451 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPP1P10451 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPP1P10451 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPP1P10451 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPP1P10451 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPP1P10451 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPP1P10451 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPP1P10451 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPP1P10451 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SPP1P10451 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPP1P10451 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPP1P10451 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPP1P10451 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPP1P10451 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPP1P10451 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPP1P10451 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPP1P10451 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPP1P10451 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPP1P10451 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPP1P10451 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPP1P10451 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPP1P10451 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPP1P10451 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPP1P10451 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPP1P10451 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPP1P10451 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPP1P10451 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPP1P10451 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPP1P10451 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPP1P10451 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPP1P10451 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPP1P10451 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPP1P10451 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPP1P10451 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPP1P10451 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPP1P10451 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPP1P10451 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPP1P10451 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPP1P10451 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPP1P10451 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPP1P10451 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPP1P10451 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPP1P10451 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPP1P10451 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPP1P10451 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPP1P10451 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPP1P10451 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPP1P10451 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPP1P10451 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPP1P10451 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPP1P10451 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPP1P10451 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPP1P10451 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPP1P10451 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms