Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA3

SNHG28, Putative uncharacterized protein SNHG28, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG28P0DPA3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNHG28P0DPA3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNHG28P0DPA3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNHG28P0DPA3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SNHG28P0DPA3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SNHG28P0DPA3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNHG28P0DPA3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SNHG28P0DPA3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNHG28P0DPA3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNHG28P0DPA3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNHG28P0DPA3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNHG28P0DPA3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNHG28P0DPA3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNHG28P0DPA3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNHG28P0DPA3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNHG28P0DPA3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SNHG28P0DPA3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNHG28P0DPA3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNHG28P0DPA3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SNHG28P0DPA3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SNHG28P0DPA3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNHG28P0DPA3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNHG28P0DPA3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNHG28P0DPA3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNHG28P0DPA3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNHG28P0DPA3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNHG28P0DPA3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SNHG28P0DPA3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SNHG28P0DPA3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNHG28P0DPA3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNHG28P0DPA3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNHG28P0DPA3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNHG28P0DPA3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNHG28P0DPA3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNHG28P0DPA3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SNHG28P0DPA3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SNHG28P0DPA3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SNHG28P0DPA3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SNHG28P0DPA3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNHG28P0DPA3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SNHG28P0DPA3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SNHG28P0DPA3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNHG28P0DPA3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNHG28P0DPA3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNHG28P0DPA3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNHG28P0DPA3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNHG28P0DPA3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNHG28P0DPA3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms