Protein–RNA interactions for Protein: P0DN86

CGB3, Choriogonadotropin subunit beta 3, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB3P0DN86 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CGB3P0DN86 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CGB3P0DN86 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CGB3P0DN86 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CGB3P0DN86 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CGB3P0DN86 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CGB3P0DN86 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGB3P0DN86 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGB3P0DN86 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGB3P0DN86 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGB3P0DN86 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGB3P0DN86 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGB3P0DN86 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGB3P0DN86 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGB3P0DN86 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CGB3P0DN86 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CGB3P0DN86 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGB3P0DN86 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGB3P0DN86 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGB3P0DN86 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CGB3P0DN86 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CGB3P0DN86 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CGB3P0DN86 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CGB3P0DN86 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CGB3P0DN86 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CGB3P0DN86 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CGB3P0DN86 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CGB3P0DN86 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CGB3P0DN86 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CGB3P0DN86 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CGB3P0DN86 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CGB3P0DN86 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CGB3P0DN86 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CGB3P0DN86 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CGB3P0DN86 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CGB3P0DN86 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CGB3P0DN86 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CGB3P0DN86 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CGB3P0DN86 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CGB3P0DN86 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CGB3P0DN86 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CGB3P0DN86 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CGB3P0DN86 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CGB3P0DN86 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CGB3P0DN86 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms