Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW4

SMIM10L2A, Small integral membrane protein 10-like protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2AP0DMW4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SMIM10L2AP0DMW4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMIM10L2AP0DMW4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMIM10L2AP0DMW4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SMIM10L2AP0DMW4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMIM10L2AP0DMW4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMIM10L2AP0DMW4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMIM10L2AP0DMW4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMIM10L2AP0DMW4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMIM10L2AP0DMW4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM10L2AP0DMW4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMIM10L2AP0DMW4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMIM10L2AP0DMW4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMIM10L2AP0DMW4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMIM10L2AP0DMW4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMIM10L2AP0DMW4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMIM10L2AP0DMW4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SMIM10L2AP0DMW4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM10L2AP0DMW4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM10L2AP0DMW4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM10L2AP0DMW4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM10L2AP0DMW4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM10L2AP0DMW4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM10L2AP0DMW4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM10L2AP0DMW4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM10L2AP0DMW4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM10L2AP0DMW4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM10L2AP0DMW4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM10L2AP0DMW4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMIM10L2AP0DMW4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMIM10L2AP0DMW4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMIM10L2AP0DMW4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMIM10L2AP0DMW4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMIM10L2AP0DMW4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SMIM10L2AP0DMW4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMIM10L2AP0DMW4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMIM10L2AP0DMW4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMIM10L2AP0DMW4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SMIM10L2AP0DMW4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMIM10L2AP0DMW4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMIM10L2AP0DMW4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMIM10L2AP0DMW4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMIM10L2AP0DMW4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms