Protein–RNA interactions for Protein: P0DMP2

SRGAP2B, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2BP0DMP2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SRGAP2BP0DMP2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms