Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms