Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFTA3P0C7M3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms