Protein–RNA interactions for Protein: P09455

RBP1, Retinol-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP1P09455 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBP1P09455 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RBP1P09455 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBP1P09455 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBP1P09455 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBP1P09455 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBP1P09455 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBP1P09455 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBP1P09455 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBP1P09455 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBP1P09455 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBP1P09455 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RBP1P09455 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBP1P09455 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RBP1P09455 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBP1P09455 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBP1P09455 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBP1P09455 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBP1P09455 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RBP1P09455 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBP1P09455 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBP1P09455 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBP1P09455 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBP1P09455 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBP1P09455 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBP1P09455 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBP1P09455 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBP1P09455 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBP1P09455 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBP1P09455 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBP1P09455 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBP1P09455 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBP1P09455 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBP1P09455 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBP1P09455 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBP1P09455 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBP1P09455 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBP1P09455 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBP1P09455 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBP1P09455 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RBP1P09455 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RBP1P09455 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RBP1P09455 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBP1P09455 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBP1P09455 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBP1P09455 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBP1P09455 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RBP1P09455 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBP1P09455 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBP1P09455 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBP1P09455 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBP1P09455 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBP1P09455 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBP1P09455 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBP1P09455 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBP1P09455 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBP1P09455 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBP1P09455 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBP1P09455 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBP1P09455 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBP1P09455 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBP1P09455 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBP1P09455 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBP1P09455 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP1P09455 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP1P09455 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP1P09455 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP1P09455 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP1P09455 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP1P09455 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP1P09455 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP1P09455 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP1P09455 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP1P09455 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP1P09455 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP1P09455 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP1P09455 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP1P09455 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP1P09455 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP1P09455 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP1P09455 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBP1P09455 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBP1P09455 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBP1P09455 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBP1P09455 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBP1P09455 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBP1P09455 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBP1P09455 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBP1P09455 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBP1P09455 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBP1P09455 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBP1P09455 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBP1P09455 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBP1P09455 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBP1P09455 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP1P09455 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP1P09455 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP1P09455 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP1P09455 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP1P09455 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms