Protein–RNA interactions for Protein: P09017

HOXC4, Homeobox protein Hox-C4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC4P09017 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC4P09017 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC4P09017 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC4P09017 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC4P09017 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC4P09017 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC4P09017 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC4P09017 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC4P09017 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC4P09017 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC4P09017 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC4P09017 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC4P09017 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC4P09017 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC4P09017 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC4P09017 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC4P09017 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC4P09017 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC4P09017 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC4P09017 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC4P09017 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC4P09017 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC4P09017 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC4P09017 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC4P09017 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC4P09017 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC4P09017 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC4P09017 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC4P09017 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC4P09017 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC4P09017 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC4P09017 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC4P09017 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC4P09017 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC4P09017 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC4P09017 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC4P09017 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC4P09017 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC4P09017 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC4P09017 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC4P09017 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC4P09017 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC4P09017 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC4P09017 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC4P09017 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms