Protein–RNA interactions for Protein: P08865

RPSA, 40S ribosomal protein SA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP08865 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPSAP08865 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPSAP08865 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPSAP08865 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPSAP08865 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPSAP08865 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPSAP08865 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPSAP08865 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPSAP08865 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPSAP08865 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPSAP08865 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPSAP08865 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPSAP08865 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPSAP08865 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPSAP08865 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPSAP08865 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPSAP08865 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPSAP08865 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPSAP08865 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPSAP08865 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPSAP08865 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPSAP08865 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPSAP08865 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPSAP08865 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPSAP08865 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPSAP08865 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RPSAP08865 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPSAP08865 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPSAP08865 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPSAP08865 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPSAP08865 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPSAP08865 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPSAP08865 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPSAP08865 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPSAP08865 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RPSAP08865 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPSAP08865 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPSAP08865 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPSAP08865 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPSAP08865 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPSAP08865 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPSAP08865 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPSAP08865 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPSAP08865 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPSAP08865 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPSAP08865 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPSAP08865 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPSAP08865 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RPSAP08865 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RPSAP08865 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPSAP08865 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPSAP08865 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPSAP08865 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPSAP08865 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPSAP08865 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPSAP08865 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPSAP08865 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPSAP08865 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPSAP08865 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPSAP08865 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPSAP08865 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPSAP08865 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPSAP08865 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPSAP08865 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPSAP08865 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPSAP08865 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPSAP08865 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPSAP08865 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPSAP08865 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPSAP08865 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPSAP08865 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPSAP08865 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPSAP08865 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPSAP08865 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPSAP08865 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPSAP08865 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPSAP08865 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPSAP08865 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPSAP08865 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPSAP08865 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPSAP08865 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPSAP08865 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPSAP08865 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPSAP08865 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPSAP08865 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPSAP08865 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPSAP08865 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPSAP08865 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPSAP08865 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPSAP08865 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPSAP08865 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPSAP08865 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPSAP08865 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPSAP08865 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPSAP08865 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPSAP08865 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPSAP08865 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPSAP08865 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPSAP08865 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPSAP08865 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms