Protein–RNA interactions for Protein: P08493

MGP, Matrix Gla protein, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGPP08493 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MGPP08493 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MGPP08493 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MGPP08493 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MGPP08493 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MGPP08493 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MGPP08493 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MGPP08493 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MGPP08493 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MGPP08493 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MGPP08493 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MGPP08493 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MGPP08493 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MGPP08493 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MGPP08493 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MGPP08493 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MGPP08493 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MGPP08493 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MGPP08493 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MGPP08493 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MGPP08493 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MGPP08493 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MGPP08493 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MGPP08493 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MGPP08493 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MGPP08493 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MGPP08493 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MGPP08493 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MGPP08493 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MGPP08493 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MGPP08493 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MGPP08493 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MGPP08493 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MGPP08493 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MGPP08493 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MGPP08493 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MGPP08493 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MGPP08493 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MGPP08493 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MGPP08493 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MGPP08493 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MGPP08493 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MGPP08493 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MGPP08493 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MGPP08493 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MGPP08493 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MGPP08493 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MGPP08493 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MGPP08493 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MGPP08493 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MGPP08493 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MGPP08493 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MGPP08493 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MGPP08493 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MGPP08493 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MGPP08493 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MGPP08493 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MGPP08493 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MGPP08493 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MGPP08493 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MGPP08493 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MGPP08493 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MGPP08493 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MGPP08493 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MGPP08493 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MGPP08493 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MGPP08493 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MGPP08493 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MGPP08493 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MGPP08493 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MGPP08493 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MGPP08493 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MGPP08493 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MGPP08493 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MGPP08493 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MGPP08493 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MGPP08493 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MGPP08493 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MGPP08493 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MGPP08493 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MGPP08493 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MGPP08493 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MGPP08493 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MGPP08493 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MGPP08493 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MGPP08493 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MGPP08493 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MGPP08493 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MGPP08493 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MGPP08493 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MGPP08493 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MGPP08493 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MGPP08493 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MGPP08493 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MGPP08493 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MGPP08493 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MGPP08493 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MGPP08493 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MGPP08493 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MGPP08493 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms