Protein–RNA interactions for Protein: P07948

LYN, Tyrosine-protein kinase Lyn, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNP07948 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYNP07948 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYNP07948 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYNP07948 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYNP07948 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYNP07948 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYNP07948 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYNP07948 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYNP07948 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYNP07948 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYNP07948 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYNP07948 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYNP07948 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYNP07948 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYNP07948 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYNP07948 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYNP07948 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYNP07948 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYNP07948 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYNP07948 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LYNP07948 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYNP07948 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYNP07948 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYNP07948 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYNP07948 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYNP07948 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYNP07948 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYNP07948 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYNP07948 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYNP07948 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYNP07948 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYNP07948 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYNP07948 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYNP07948 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYNP07948 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYNP07948 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYNP07948 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYNP07948 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYNP07948 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYNP07948 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYNP07948 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LYNP07948 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYNP07948 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYNP07948 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYNP07948 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYNP07948 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LYNP07948 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LYNP07948 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LYNP07948 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LYNP07948 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LYNP07948 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LYNP07948 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LYNP07948 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LYNP07948 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LYNP07948 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LYNP07948 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LYNP07948 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LYNP07948 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LYNP07948 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LYNP07948 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LYNP07948 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LYNP07948 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LYNP07948 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LYNP07948 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LYNP07948 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LYNP07948 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LYNP07948 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LYNP07948 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
LYNP07948 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LYNP07948 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LYNP07948 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LYNP07948 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LYNP07948 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LYNP07948 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LYNP07948 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LYNP07948 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LYNP07948 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LYNP07948 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LYNP07948 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LYNP07948 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LYNP07948 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LYNP07948 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LYNP07948 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LYNP07948 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LYNP07948 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LYNP07948 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LYNP07948 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LYNP07948 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LYNP07948 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LYNP07948 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LYNP07948 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LYNP07948 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LYNP07948 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LYNP07948 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LYNP07948 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LYNP07948 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LYNP07948 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LYNP07948 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LYNP07948 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LYNP07948 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms