Protein–RNA interactions for Protein: P07864

LDHC, L-lactate dehydrogenase C chain, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHCP07864 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LDHCP07864 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LDHCP07864 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LDHCP07864 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
LDHCP07864 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LDHCP07864 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LDHCP07864 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LDHCP07864 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LDHCP07864 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LDHCP07864 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LDHCP07864 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LDHCP07864 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LDHCP07864 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LDHCP07864 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LDHCP07864 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LDHCP07864 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LDHCP07864 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LDHCP07864 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LDHCP07864 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LDHCP07864 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LDHCP07864 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LDHCP07864 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LDHCP07864 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LDHCP07864 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LDHCP07864 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LDHCP07864 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LDHCP07864 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LDHCP07864 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LDHCP07864 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LDHCP07864 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LDHCP07864 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LDHCP07864 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LDHCP07864 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LDHCP07864 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LDHCP07864 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LDHCP07864 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LDHCP07864 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LDHCP07864 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LDHCP07864 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LDHCP07864 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
LDHCP07864 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LDHCP07864 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
LDHCP07864 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
LDHCP07864 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
LDHCP07864 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
LDHCP07864 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LDHCP07864 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LDHCP07864 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LDHCP07864 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LDHCP07864 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LDHCP07864 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LDHCP07864 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LDHCP07864 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LDHCP07864 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LDHCP07864 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LDHCP07864 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LDHCP07864 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LDHCP07864 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LDHCP07864 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LDHCP07864 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LDHCP07864 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LDHCP07864 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LDHCP07864 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LDHCP07864 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LDHCP07864 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LDHCP07864 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LDHCP07864 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LDHCP07864 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LDHCP07864 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LDHCP07864 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LDHCP07864 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LDHCP07864 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LDHCP07864 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LDHCP07864 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LDHCP07864 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LDHCP07864 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LDHCP07864 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LDHCP07864 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LDHCP07864 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LDHCP07864 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LDHCP07864 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LDHCP07864 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LDHCP07864 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LDHCP07864 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LDHCP07864 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LDHCP07864 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LDHCP07864 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LDHCP07864 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LDHCP07864 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LDHCP07864 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LDHCP07864 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LDHCP07864 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LDHCP07864 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LDHCP07864 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LDHCP07864 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LDHCP07864 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LDHCP07864 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LDHCP07864 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LDHCP07864 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LDHCP07864 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms