Protein–RNA interactions for Protein: P02679

FGG, Fibrinogen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGGP02679 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGGP02679 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGGP02679 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGGP02679 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGGP02679 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGGP02679 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGGP02679 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGGP02679 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGGP02679 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGGP02679 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGGP02679 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGGP02679 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGGP02679 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGGP02679 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGGP02679 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGGP02679 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGGP02679 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGGP02679 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGGP02679 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGGP02679 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGGP02679 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGGP02679 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGGP02679 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGGP02679 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGGP02679 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FGGP02679 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGGP02679 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGGP02679 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGGP02679 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGGP02679 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGGP02679 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGGP02679 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGGP02679 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGGP02679 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGGP02679 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGGP02679 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FGGP02679 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGGP02679 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGGP02679 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGGP02679 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGGP02679 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGGP02679 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FGGP02679 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGGP02679 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGGP02679 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGGP02679 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGGP02679 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGGP02679 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGGP02679 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGGP02679 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGGP02679 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGGP02679 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGGP02679 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGGP02679 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGGP02679 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGGP02679 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGGP02679 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGGP02679 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGGP02679 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGGP02679 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGGP02679 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGGP02679 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGGP02679 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGGP02679 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGGP02679 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGGP02679 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGGP02679 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGGP02679 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGGP02679 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGGP02679 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FGGP02679 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGGP02679 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FGGP02679 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGGP02679 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGGP02679 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGGP02679 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGGP02679 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGGP02679 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGGP02679 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGGP02679 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGGP02679 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGGP02679 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGGP02679 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGGP02679 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGGP02679 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGGP02679 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FGGP02679 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGGP02679 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGGP02679 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGGP02679 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGGP02679 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGGP02679 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGGP02679 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGGP02679 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGGP02679 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGGP02679 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGGP02679 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGGP02679 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGGP02679 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGGP02679 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms