Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOEP02649 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOEP02649 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOEP02649 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOEP02649 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOEP02649 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOEP02649 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOEP02649 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOEP02649 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOEP02649 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOEP02649 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOEP02649 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOEP02649 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOEP02649 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOEP02649 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOEP02649 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOEP02649 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOEP02649 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOEP02649 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOEP02649 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOEP02649 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOEP02649 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOEP02649 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOEP02649 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOEP02649 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOEP02649 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOEP02649 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOEP02649 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOEP02649 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOEP02649 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOEP02649 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOEP02649 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOEP02649 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOEP02649 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
APOEP02649 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
APOEP02649 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
APOEP02649 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
APOEP02649 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
APOEP02649 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
APOEP02649 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOEP02649 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOEP02649 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOEP02649 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
APOEP02649 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOEP02649 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOEP02649 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOEP02649 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
APOEP02649 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOEP02649 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOEP02649 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOEP02649 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOEP02649 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOEP02649 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOEP02649 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOEP02649 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOEP02649 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOEP02649 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOEP02649 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOEP02649 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOEP02649 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOEP02649 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOEP02649 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOEP02649 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOEP02649 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOEP02649 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOEP02649 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOEP02649 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOEP02649 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOEP02649 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOEP02649 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOEP02649 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOEP02649 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOEP02649 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOEP02649 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOEP02649 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOEP02649 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOEP02649 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOEP02649 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOEP02649 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOEP02649 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOEP02649 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOEP02649 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOEP02649 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOEP02649 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOEP02649 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOEP02649 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
APOEP02649 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOEP02649 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOEP02649 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOEP02649 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
APOEP02649 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOEP02649 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOEP02649 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOEP02649 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOEP02649 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOEP02649 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOEP02649 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOEP02649 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOEP02649 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOEP02649 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms