Protein–RNA interactions for Protein: P01133

EGF, Pro-epidermal growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFP01133 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EGFP01133 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EGFP01133 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EGFP01133 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EGFP01133 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EGFP01133 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EGFP01133 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EGFP01133 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EGFP01133 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EGFP01133 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EGFP01133 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EGFP01133 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EGFP01133 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EGFP01133 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EGFP01133 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EGFP01133 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EGFP01133 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EGFP01133 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EGFP01133 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EGFP01133 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EGFP01133 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EGFP01133 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EGFP01133 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EGFP01133 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EGFP01133 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EGFP01133 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EGFP01133 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EGFP01133 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EGFP01133 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EGFP01133 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EGFP01133 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EGFP01133 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EGFP01133 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EGFP01133 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EGFP01133 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EGFP01133 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EGFP01133 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EGFP01133 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EGFP01133 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EGFP01133 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EGFP01133 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EGFP01133 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EGFP01133 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EGFP01133 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EGFP01133 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EGFP01133 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EGFP01133 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EGFP01133 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EGFP01133 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EGFP01133 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EGFP01133 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EGFP01133 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EGFP01133 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EGFP01133 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EGFP01133 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EGFP01133 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EGFP01133 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EGFP01133 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EGFP01133 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EGFP01133 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EGFP01133 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EGFP01133 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EGFP01133 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EGFP01133 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EGFP01133 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EGFP01133 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EGFP01133 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EGFP01133 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EGFP01133 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EGFP01133 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EGFP01133 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EGFP01133 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EGFP01133 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EGFP01133 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EGFP01133 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EGFP01133 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EGFP01133 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EGFP01133 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EGFP01133 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EGFP01133 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EGFP01133 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EGFP01133 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EGFP01133 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EGFP01133 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EGFP01133 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EGFP01133 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EGFP01133 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EGFP01133 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EGFP01133 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EGFP01133 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EGFP01133 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EGFP01133 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EGFP01133 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EGFP01133 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EGFP01133 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EGFP01133 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EGFP01133 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EGFP01133 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EGFP01133 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EGFP01133 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms