Protein–RNA interactions for Protein: O95741

CPNE6, Copine-6, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE6O95741 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPNE6O95741 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms