Protein–RNA interactions for Protein: O95522

PRAMEF12, PRAME family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF12O95522 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF12O95522 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF12O95522 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF12O95522 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF12O95522 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF12O95522 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF12O95522 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF12O95522 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF12O95522 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF12O95522 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF12O95522 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF12O95522 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF12O95522 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF12O95522 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF12O95522 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF12O95522 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF12O95522 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF12O95522 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF12O95522 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF12O95522 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF12O95522 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF12O95522 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF12O95522 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF12O95522 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF12O95522 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF12O95522 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF12O95522 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF12O95522 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF12O95522 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF12O95522 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF12O95522 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF12O95522 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF12O95522 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF12O95522 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF12O95522 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF12O95522 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF12O95522 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF12O95522 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF12O95522 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF12O95522 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF12O95522 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF12O95522 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF12O95522 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
PRAMEF12O95522 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRAMEF12O95522 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms