Protein–RNA interactions for Protein: O95460

MATN4, Matrilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN4O95460 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MATN4O95460 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MATN4O95460 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MATN4O95460 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MATN4O95460 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MATN4O95460 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MATN4O95460 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MATN4O95460 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MATN4O95460 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MATN4O95460 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MATN4O95460 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MATN4O95460 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MATN4O95460 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MATN4O95460 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MATN4O95460 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MATN4O95460 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MATN4O95460 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MATN4O95460 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MATN4O95460 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MATN4O95460 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MATN4O95460 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MATN4O95460 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MATN4O95460 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MATN4O95460 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MATN4O95460 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MATN4O95460 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MATN4O95460 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MATN4O95460 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MATN4O95460 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MATN4O95460 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MATN4O95460 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MATN4O95460 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MATN4O95460 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MATN4O95460 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MATN4O95460 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MATN4O95460 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MATN4O95460 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MATN4O95460 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MATN4O95460 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MATN4O95460 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MATN4O95460 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MATN4O95460 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MATN4O95460 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MATN4O95460 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MATN4O95460 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MATN4O95460 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MATN4O95460 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MATN4O95460 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MATN4O95460 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MATN4O95460 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MATN4O95460 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MATN4O95460 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MATN4O95460 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MATN4O95460 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MATN4O95460 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MATN4O95460 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MATN4O95460 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MATN4O95460 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MATN4O95460 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MATN4O95460 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MATN4O95460 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MATN4O95460 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MATN4O95460 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MATN4O95460 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MATN4O95460 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MATN4O95460 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MATN4O95460 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MATN4O95460 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MATN4O95460 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MATN4O95460 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MATN4O95460 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MATN4O95460 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MATN4O95460 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MATN4O95460 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MATN4O95460 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MATN4O95460 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MATN4O95460 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MATN4O95460 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MATN4O95460 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MATN4O95460 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MATN4O95460 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MATN4O95460 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MATN4O95460 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MATN4O95460 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MATN4O95460 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MATN4O95460 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN4O95460 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN4O95460 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN4O95460 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN4O95460 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN4O95460 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN4O95460 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN4O95460 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN4O95460 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN4O95460 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN4O95460 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MATN4O95460 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MATN4O95460 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MATN4O95460 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MATN4O95460 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.7 ms