Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAPBO95292 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAPBO95292 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAPBO95292 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAPBO95292 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAPBO95292 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAPBO95292 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAPBO95292 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAPBO95292 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAPBO95292 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAPBO95292 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAPBO95292 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAPBO95292 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAPBO95292 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAPBO95292 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAPBO95292 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAPBO95292 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAPBO95292 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAPBO95292 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAPBO95292 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAPBO95292 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAPBO95292 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAPBO95292 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAPBO95292 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAPBO95292 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAPBO95292 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAPBO95292 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAPBO95292 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAPBO95292 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAPBO95292 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAPBO95292 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAPBO95292 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAPBO95292 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAPBO95292 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAPBO95292 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
VAPBO95292 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAPBO95292 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAPBO95292 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAPBO95292 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAPBO95292 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAPBO95292 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAPBO95292 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAPBO95292 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAPBO95292 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAPBO95292 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VAPBO95292 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VAPBO95292 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VAPBO95292 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VAPBO95292 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VAPBO95292 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VAPBO95292 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VAPBO95292 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VAPBO95292 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VAPBO95292 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAPBO95292 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAPBO95292 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAPBO95292 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAPBO95292 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAPBO95292 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAPBO95292 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VAPBO95292 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VAPBO95292 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAPBO95292 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAPBO95292 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAPBO95292 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAPBO95292 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAPBO95292 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAPBO95292 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAPBO95292 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAPBO95292 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAPBO95292 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAPBO95292 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAPBO95292 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAPBO95292 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAPBO95292 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAPBO95292 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAPBO95292 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAPBO95292 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAPBO95292 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAPBO95292 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAPBO95292 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAPBO95292 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAPBO95292 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAPBO95292 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAPBO95292 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAPBO95292 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAPBO95292 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAPBO95292 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAPBO95292 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAPBO95292 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAPBO95292 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAPBO95292 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAPBO95292 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAPBO95292 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAPBO95292 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAPBO95292 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAPBO95292 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAPBO95292 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAPBO95292 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAPBO95292 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms