Protein–RNA interactions for Protein: O94782

USP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP1O94782 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP1O94782 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP1O94782 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP1O94782 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP1O94782 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP1O94782 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP1O94782 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP1O94782 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP1O94782 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP1O94782 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP1O94782 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP1O94782 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP1O94782 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP1O94782 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP1O94782 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP1O94782 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP1O94782 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP1O94782 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP1O94782 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP1O94782 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP1O94782 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP1O94782 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP1O94782 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP1O94782 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP1O94782 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP1O94782 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP1O94782 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP1O94782 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP1O94782 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP1O94782 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP1O94782 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP1O94782 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP1O94782 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP1O94782 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP1O94782 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP1O94782 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP1O94782 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP1O94782 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP1O94782 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP1O94782 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
USP1O94782 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP1O94782 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP1O94782 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP1O94782 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP1O94782 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP1O94782 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP1O94782 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP1O94782 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP1O94782 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP1O94782 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP1O94782 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP1O94782 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP1O94782 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP1O94782 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP1O94782 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP1O94782 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP1O94782 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP1O94782 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP1O94782 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP1O94782 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP1O94782 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP1O94782 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP1O94782 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP1O94782 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP1O94782 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP1O94782 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP1O94782 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP1O94782 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP1O94782 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP1O94782 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP1O94782 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP1O94782 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP1O94782 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP1O94782 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP1O94782 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP1O94782 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP1O94782 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP1O94782 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP1O94782 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP1O94782 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP1O94782 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP1O94782 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP1O94782 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP1O94782 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP1O94782 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP1O94782 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP1O94782 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP1O94782 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP1O94782 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP1O94782 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP1O94782 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP1O94782 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP1O94782 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP1O94782 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP1O94782 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP1O94782 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP1O94782 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP1O94782 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP1O94782 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP1O94782 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms