Protein–RNA interactions for Protein: O76094

SRP72, Signal recognition particle subunit SRP72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP72O76094 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRP72O76094 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRP72O76094 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRP72O76094 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRP72O76094 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SRP72O76094 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRP72O76094 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRP72O76094 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRP72O76094 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRP72O76094 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRP72O76094 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRP72O76094 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRP72O76094 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRP72O76094 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRP72O76094 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRP72O76094 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRP72O76094 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRP72O76094 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRP72O76094 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRP72O76094 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRP72O76094 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SRP72O76094 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SRP72O76094 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SRP72O76094 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRP72O76094 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRP72O76094 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRP72O76094 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRP72O76094 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRP72O76094 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRP72O76094 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRP72O76094 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRP72O76094 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRP72O76094 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRP72O76094 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRP72O76094 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRP72O76094 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRP72O76094 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRP72O76094 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRP72O76094 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRP72O76094 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRP72O76094 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRP72O76094 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRP72O76094 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRP72O76094 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRP72O76094 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRP72O76094 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP72O76094 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP72O76094 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP72O76094 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP72O76094 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP72O76094 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP72O76094 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP72O76094 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP72O76094 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP72O76094 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP72O76094 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP72O76094 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP72O76094 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP72O76094 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP72O76094 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP72O76094 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP72O76094 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP72O76094 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP72O76094 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP72O76094 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP72O76094 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP72O76094 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP72O76094 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP72O76094 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP72O76094 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP72O76094 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP72O76094 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP72O76094 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP72O76094 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP72O76094 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP72O76094 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP72O76094 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP72O76094 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP72O76094 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP72O76094 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRP72O76094 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRP72O76094 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRP72O76094 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRP72O76094 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRP72O76094 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRP72O76094 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRP72O76094 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRP72O76094 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRP72O76094 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRP72O76094 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRP72O76094 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRP72O76094 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRP72O76094 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRP72O76094 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRP72O76094 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRP72O76094 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRP72O76094 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRP72O76094 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRP72O76094 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRP72O76094 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms