Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCTN3O75935 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms