Protein–RNA interactions for Protein: O75818

RPP40, Ribonuclease P protein subunit p40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPP40O75818 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPP40O75818 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RPP40O75818 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPP40O75818 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RPP40O75818 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPP40O75818 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPP40O75818 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPP40O75818 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPP40O75818 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPP40O75818 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPP40O75818 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPP40O75818 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPP40O75818 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPP40O75818 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPP40O75818 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPP40O75818 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPP40O75818 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPP40O75818 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPP40O75818 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPP40O75818 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPP40O75818 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPP40O75818 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPP40O75818 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPP40O75818 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RPP40O75818 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPP40O75818 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPP40O75818 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPP40O75818 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPP40O75818 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPP40O75818 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPP40O75818 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPP40O75818 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPP40O75818 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPP40O75818 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPP40O75818 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPP40O75818 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPP40O75818 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPP40O75818 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPP40O75818 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPP40O75818 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPP40O75818 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPP40O75818 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPP40O75818 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPP40O75818 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPP40O75818 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RPP40O75818 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPP40O75818 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPP40O75818 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPP40O75818 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPP40O75818 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPP40O75818 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPP40O75818 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPP40O75818 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RPP40O75818 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPP40O75818 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPP40O75818 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPP40O75818 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPP40O75818 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPP40O75818 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPP40O75818 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPP40O75818 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPP40O75818 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPP40O75818 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPP40O75818 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPP40O75818 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPP40O75818 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPP40O75818 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPP40O75818 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPP40O75818 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RPP40O75818 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPP40O75818 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPP40O75818 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPP40O75818 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPP40O75818 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPP40O75818 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPP40O75818 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPP40O75818 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPP40O75818 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPP40O75818 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPP40O75818 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPP40O75818 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPP40O75818 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPP40O75818 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPP40O75818 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPP40O75818 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPP40O75818 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPP40O75818 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RPP40O75818 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPP40O75818 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPP40O75818 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPP40O75818 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPP40O75818 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPP40O75818 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RPP40O75818 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPP40O75818 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPP40O75818 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPP40O75818 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPP40O75818 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPP40O75818 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPP40O75818 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms