Protein–RNA interactions for Protein: O75530

EED, Polycomb protein EED, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEDO75530 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EEDO75530 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EEDO75530 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EEDO75530 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EEDO75530 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EEDO75530 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EEDO75530 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EEDO75530 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EEDO75530 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EEDO75530 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EEDO75530 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EEDO75530 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EEDO75530 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EEDO75530 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EEDO75530 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EEDO75530 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
EEDO75530 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EEDO75530 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EEDO75530 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EEDO75530 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EEDO75530 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EEDO75530 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EEDO75530 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EEDO75530 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EEDO75530 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EEDO75530 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
EEDO75530 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
EEDO75530 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EEDO75530 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EEDO75530 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EEDO75530 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EEDO75530 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EEDO75530 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EEDO75530 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EEDO75530 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EEDO75530 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EEDO75530 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EEDO75530 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EEDO75530 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EEDO75530 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEDO75530 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEDO75530 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEDO75530 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEDO75530 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEDO75530 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEDO75530 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEDO75530 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EEDO75530 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EEDO75530 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EEDO75530 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EEDO75530 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EEDO75530 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EEDO75530 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EEDO75530 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EEDO75530 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EEDO75530 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EEDO75530 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EEDO75530 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EEDO75530 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EEDO75530 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EEDO75530 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EEDO75530 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EEDO75530 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EEDO75530 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EEDO75530 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EEDO75530 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EEDO75530 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EEDO75530 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EEDO75530 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EEDO75530 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EEDO75530 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EEDO75530 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EEDO75530 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EEDO75530 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EEDO75530 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EEDO75530 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EEDO75530 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EEDO75530 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EEDO75530 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EEDO75530 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
EEDO75530 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EEDO75530 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EEDO75530 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EEDO75530 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EEDO75530 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EEDO75530 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EEDO75530 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EEDO75530 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EEDO75530 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EEDO75530 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EEDO75530 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EEDO75530 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EEDO75530 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EEDO75530 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EEDO75530 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EEDO75530 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EEDO75530 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EEDO75530 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EEDO75530 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EEDO75530 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms