Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LGR5O75473 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LGR5O75473 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LGR5O75473 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LGR5O75473 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LGR5O75473 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LGR5O75473 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LGR5O75473 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LGR5O75473 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LGR5O75473 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LGR5O75473 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LGR5O75473 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LGR5O75473 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LGR5O75473 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LGR5O75473 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LGR5O75473 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LGR5O75473 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LGR5O75473 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LGR5O75473 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LGR5O75473 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LGR5O75473 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LGR5O75473 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LGR5O75473 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LGR5O75473 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LGR5O75473 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LGR5O75473 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LGR5O75473 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LGR5O75473 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LGR5O75473 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LGR5O75473 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LGR5O75473 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LGR5O75473 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LGR5O75473 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LGR5O75473 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LGR5O75473 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LGR5O75473 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LGR5O75473 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LGR5O75473 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LGR5O75473 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LGR5O75473 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LGR5O75473 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LGR5O75473 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LGR5O75473 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LGR5O75473 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LGR5O75473 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LGR5O75473 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LGR5O75473 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LGR5O75473 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LGR5O75473 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LGR5O75473 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LGR5O75473 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LGR5O75473 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LGR5O75473 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LGR5O75473 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LGR5O75473 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LGR5O75473 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LGR5O75473 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LGR5O75473 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LGR5O75473 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LGR5O75473 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LGR5O75473 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LGR5O75473 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LGR5O75473 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LGR5O75473 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LGR5O75473 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LGR5O75473 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LGR5O75473 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LGR5O75473 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LGR5O75473 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LGR5O75473 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LGR5O75473 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LGR5O75473 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LGR5O75473 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LGR5O75473 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LGR5O75473 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LGR5O75473 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LGR5O75473 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LGR5O75473 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LGR5O75473 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LGR5O75473 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LGR5O75473 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LGR5O75473 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LGR5O75473 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LGR5O75473 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LGR5O75473 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LGR5O75473 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LGR5O75473 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LGR5O75473 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LGR5O75473 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LGR5O75473 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LGR5O75473 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LGR5O75473 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LGR5O75473 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LGR5O75473 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LGR5O75473 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LGR5O75473 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LGR5O75473 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LGR5O75473 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LGR5O75473 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LGR5O75473 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms