Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IGSF3O75054 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms