Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC22O60826 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms