Protein–RNA interactions for Protein: O60583

CCNT2, Cyclin-T2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNT2O60583 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNT2O60583 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNT2O60583 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNT2O60583 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNT2O60583 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNT2O60583 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNT2O60583 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNT2O60583 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNT2O60583 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNT2O60583 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNT2O60583 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNT2O60583 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNT2O60583 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNT2O60583 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms