Protein–RNA interactions for Protein: O60481

ZIC3, Zinc finger protein ZIC 3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC3O60481 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIC3O60481 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms