Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLIN1O60240 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLIN1O60240 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLIN1O60240 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLIN1O60240 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PLIN1O60240 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PLIN1O60240 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PLIN1O60240 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PLIN1O60240 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PLIN1O60240 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PLIN1O60240 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PLIN1O60240 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PLIN1O60240 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PLIN1O60240 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PLIN1O60240 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PLIN1O60240 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PLIN1O60240 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PLIN1O60240 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PLIN1O60240 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PLIN1O60240 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PLIN1O60240 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PLIN1O60240 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PLIN1O60240 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PLIN1O60240 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PLIN1O60240 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PLIN1O60240 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PLIN1O60240 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PLIN1O60240 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PLIN1O60240 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PLIN1O60240 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PLIN1O60240 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PLIN1O60240 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PLIN1O60240 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PLIN1O60240 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PLIN1O60240 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PLIN1O60240 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PLIN1O60240 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PLIN1O60240 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PLIN1O60240 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PLIN1O60240 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PLIN1O60240 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PLIN1O60240 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PLIN1O60240 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PLIN1O60240 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PLIN1O60240 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PLIN1O60240 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PLIN1O60240 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PLIN1O60240 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PLIN1O60240 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PLIN1O60240 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PLIN1O60240 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PLIN1O60240 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PLIN1O60240 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PLIN1O60240 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PLIN1O60240 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PLIN1O60240 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PLIN1O60240 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PLIN1O60240 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PLIN1O60240 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PLIN1O60240 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PLIN1O60240 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PLIN1O60240 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PLIN1O60240 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PLIN1O60240 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PLIN1O60240 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PLIN1O60240 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PLIN1O60240 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PLIN1O60240 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PLIN1O60240 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PLIN1O60240 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PLIN1O60240 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PLIN1O60240 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PLIN1O60240 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PLIN1O60240 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PLIN1O60240 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PLIN1O60240 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PLIN1O60240 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms