Protein–RNA interactions for Protein: O43934

MFSD11, UNC93-like protein MFSD11, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD11O43934 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MFSD11O43934 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MFSD11O43934 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MFSD11O43934 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MFSD11O43934 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MFSD11O43934 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MFSD11O43934 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MFSD11O43934 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MFSD11O43934 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MFSD11O43934 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MFSD11O43934 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MFSD11O43934 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MFSD11O43934 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MFSD11O43934 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MFSD11O43934 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MFSD11O43934 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MFSD11O43934 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MFSD11O43934 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MFSD11O43934 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MFSD11O43934 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MFSD11O43934 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MFSD11O43934 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MFSD11O43934 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MFSD11O43934 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MFSD11O43934 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MFSD11O43934 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MFSD11O43934 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MFSD11O43934 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MFSD11O43934 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MFSD11O43934 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MFSD11O43934 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MFSD11O43934 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MFSD11O43934 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MFSD11O43934 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MFSD11O43934 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MFSD11O43934 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MFSD11O43934 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MFSD11O43934 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MFSD11O43934 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MFSD11O43934 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MFSD11O43934 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MFSD11O43934 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MFSD11O43934 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MFSD11O43934 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MFSD11O43934 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MFSD11O43934 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MFSD11O43934 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MFSD11O43934 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MFSD11O43934 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MFSD11O43934 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms