Protein–RNA interactions for Protein: O43790

KRT86, Keratin, type II cuticular Hb6, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT86O43790 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT86O43790 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT86O43790 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT86O43790 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT86O43790 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT86O43790 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT86O43790 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT86O43790 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT86O43790 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT86O43790 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT86O43790 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT86O43790 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT86O43790 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT86O43790 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT86O43790 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT86O43790 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT86O43790 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT86O43790 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT86O43790 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT86O43790 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT86O43790 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT86O43790 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT86O43790 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT86O43790 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT86O43790 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT86O43790 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT86O43790 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT86O43790 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT86O43790 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT86O43790 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT86O43790 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT86O43790 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT86O43790 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT86O43790 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT86O43790 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT86O43790 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT86O43790 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT86O43790 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT86O43790 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT86O43790 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT86O43790 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT86O43790 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT86O43790 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT86O43790 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT86O43790 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT86O43790 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT86O43790 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT86O43790 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT86O43790 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT86O43790 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT86O43790 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT86O43790 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT86O43790 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT86O43790 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT86O43790 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT86O43790 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT86O43790 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT86O43790 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT86O43790 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT86O43790 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT86O43790 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT86O43790 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT86O43790 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT86O43790 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT86O43790 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT86O43790 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT86O43790 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT86O43790 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT86O43790 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT86O43790 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT86O43790 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT86O43790 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT86O43790 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT86O43790 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT86O43790 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT86O43790 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT86O43790 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT86O43790 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT86O43790 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT86O43790 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT86O43790 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT86O43790 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT86O43790 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT86O43790 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT86O43790 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT86O43790 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT86O43790 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT86O43790 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT86O43790 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT86O43790 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT86O43790 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT86O43790 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT86O43790 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT86O43790 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT86O43790 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT86O43790 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT86O43790 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT86O43790 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT86O43790 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT86O43790 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms