Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMP2AO43633 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMP2AO43633 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMP2AO43633 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMP2AO43633 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMP2AO43633 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMP2AO43633 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMP2AO43633 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMP2AO43633 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMP2AO43633 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMP2AO43633 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMP2AO43633 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMP2AO43633 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMP2AO43633 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMP2AO43633 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMP2AO43633 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMP2AO43633 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMP2AO43633 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMP2AO43633 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP2AO43633 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP2AO43633 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP2AO43633 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP2AO43633 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP2AO43633 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP2AO43633 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP2AO43633 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP2AO43633 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP2AO43633 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHMP2AO43633 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHMP2AO43633 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHMP2AO43633 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMP2AO43633 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMP2AO43633 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMP2AO43633 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMP2AO43633 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMP2AO43633 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMP2AO43633 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms