Protein–RNA interactions for Protein: O43612

HCRT, Orexin, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCRTO43612 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HCRTO43612 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HCRTO43612 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HCRTO43612 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HCRTO43612 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HCRTO43612 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HCRTO43612 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HCRTO43612 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HCRTO43612 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HCRTO43612 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HCRTO43612 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HCRTO43612 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HCRTO43612 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HCRTO43612 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HCRTO43612 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HCRTO43612 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HCRTO43612 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HCRTO43612 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HCRTO43612 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HCRTO43612 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HCRTO43612 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HCRTO43612 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HCRTO43612 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HCRTO43612 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HCRTO43612 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HCRTO43612 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HCRTO43612 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HCRTO43612 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HCRTO43612 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HCRTO43612 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HCRTO43612 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HCRTO43612 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HCRTO43612 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HCRTO43612 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HCRTO43612 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HCRTO43612 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HCRTO43612 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HCRTO43612 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HCRTO43612 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HCRTO43612 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HCRTO43612 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HCRTO43612 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HCRTO43612 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HCRTO43612 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HCRTO43612 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HCRTO43612 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HCRTO43612 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HCRTO43612 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HCRTO43612 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HCRTO43612 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HCRTO43612 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HCRTO43612 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HCRTO43612 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HCRTO43612 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HCRTO43612 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HCRTO43612 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HCRTO43612 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HCRTO43612 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HCRTO43612 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HCRTO43612 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HCRTO43612 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HCRTO43612 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HCRTO43612 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HCRTO43612 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
HCRTO43612 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HCRTO43612 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HCRTO43612 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
HCRTO43612 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HCRTO43612 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HCRTO43612 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HCRTO43612 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HCRTO43612 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HCRTO43612 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HCRTO43612 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HCRTO43612 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HCRTO43612 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HCRTO43612 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HCRTO43612 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HCRTO43612 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HCRTO43612 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HCRTO43612 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HCRTO43612 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HCRTO43612 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HCRTO43612 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HCRTO43612 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HCRTO43612 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HCRTO43612 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HCRTO43612 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HCRTO43612 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HCRTO43612 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HCRTO43612 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HCRTO43612 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HCRTO43612 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HCRTO43612 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HCRTO43612 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HCRTO43612 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HCRTO43612 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HCRTO43612 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HCRTO43612 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HCRTO43612 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms