Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms