Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MAP3K13O43283 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAP3K13O43283 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAP3K13O43283 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAP3K13O43283 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms