Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSMD3O43242 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD3O43242 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms