Protein–RNA interactions for Protein: O15232

MATN3, Matrilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN3O15232 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MATN3O15232 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MATN3O15232 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MATN3O15232 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MATN3O15232 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MATN3O15232 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MATN3O15232 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MATN3O15232 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MATN3O15232 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MATN3O15232 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MATN3O15232 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MATN3O15232 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MATN3O15232 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MATN3O15232 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MATN3O15232 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MATN3O15232 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MATN3O15232 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MATN3O15232 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MATN3O15232 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MATN3O15232 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MATN3O15232 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MATN3O15232 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MATN3O15232 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MATN3O15232 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MATN3O15232 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MATN3O15232 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MATN3O15232 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MATN3O15232 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MATN3O15232 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MATN3O15232 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MATN3O15232 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MATN3O15232 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MATN3O15232 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MATN3O15232 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MATN3O15232 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MATN3O15232 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MATN3O15232 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MATN3O15232 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MATN3O15232 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MATN3O15232 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MATN3O15232 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
MATN3O15232 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MATN3O15232 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MATN3O15232 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MATN3O15232 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MATN3O15232 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MATN3O15232 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MATN3O15232 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MATN3O15232 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MATN3O15232 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MATN3O15232 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MATN3O15232 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MATN3O15232 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MATN3O15232 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MATN3O15232 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MATN3O15232 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MATN3O15232 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MATN3O15232 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MATN3O15232 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MATN3O15232 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MATN3O15232 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MATN3O15232 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MATN3O15232 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MATN3O15232 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MATN3O15232 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MATN3O15232 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MATN3O15232 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MATN3O15232 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MATN3O15232 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MATN3O15232 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MATN3O15232 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MATN3O15232 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MATN3O15232 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MATN3O15232 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MATN3O15232 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MATN3O15232 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MATN3O15232 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MATN3O15232 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MATN3O15232 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MATN3O15232 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MATN3O15232 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MATN3O15232 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MATN3O15232 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MATN3O15232 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MATN3O15232 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MATN3O15232 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MATN3O15232 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MATN3O15232 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MATN3O15232 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MATN3O15232 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MATN3O15232 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MATN3O15232 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MATN3O15232 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MATN3O15232 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MATN3O15232 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MATN3O15232 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MATN3O15232 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MATN3O15232 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MATN3O15232 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MATN3O15232 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms