Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBDO15205 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBDO15205 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBDO15205 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBDO15205 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBDO15205 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
UBDO15205 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBDO15205 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBDO15205 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBDO15205 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBDO15205 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBDO15205 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBDO15205 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBDO15205 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBDO15205 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBDO15205 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBDO15205 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBDO15205 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBDO15205 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBDO15205 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBDO15205 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBDO15205 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBDO15205 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBDO15205 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
UBDO15205 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBDO15205 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBDO15205 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBDO15205 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBDO15205 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBDO15205 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBDO15205 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBDO15205 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBDO15205 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
UBDO15205 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBDO15205 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBDO15205 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBDO15205 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBDO15205 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBDO15205 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBDO15205 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBDO15205 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
UBDO15205 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBDO15205 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBDO15205 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBDO15205 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBDO15205 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBDO15205 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBDO15205 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBDO15205 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBDO15205 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBDO15205 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBDO15205 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBDO15205 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
UBDO15205 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBDO15205 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBDO15205 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBDO15205 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBDO15205 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBDO15205 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBDO15205 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBDO15205 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBDO15205 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBDO15205 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBDO15205 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
UBDO15205 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBDO15205 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBDO15205 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBDO15205 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBDO15205 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBDO15205 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBDO15205 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBDO15205 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBDO15205 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBDO15205 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBDO15205 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBDO15205 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBDO15205 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBDO15205 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBDO15205 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBDO15205 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBDO15205 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBDO15205 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBDO15205 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBDO15205 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBDO15205 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBDO15205 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBDO15205 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBDO15205 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
UBDO15205 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBDO15205 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBDO15205 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBDO15205 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBDO15205 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBDO15205 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBDO15205 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBDO15205 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBDO15205 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBDO15205 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBDO15205 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBDO15205 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms