Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
SYNJ2O15056 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
SYNJ2O15056 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
SYNJ2O15056 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
SYNJ2O15056 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
SYNJ2O15056 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
SYNJ2O15056 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
SYNJ2O15056 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
SYNJ2O15056 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
SYNJ2O15056 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
SYNJ2O15056 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
SYNJ2O15056 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
SYNJ2O15056 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
SYNJ2O15056 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
SYNJ2O15056 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
SYNJ2O15056 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
SYNJ2O15056 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
SYNJ2O15056 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
SYNJ2O15056 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
SYNJ2O15056 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
SYNJ2O15056 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
SYNJ2O15056 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
SYNJ2O15056 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC37.35■■■■□ 3.57
SYNJ2O15056 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
SYNJ2O15056 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
SYNJ2O15056 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
SYNJ2O15056 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
SYNJ2O15056 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
SYNJ2O15056 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
SYNJ2O15056 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
SYNJ2O15056 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
SYNJ2O15056 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
SYNJ2O15056 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
SYNJ2O15056 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
SYNJ2O15056 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
SYNJ2O15056 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
SYNJ2O15056 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
SYNJ2O15056 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
SYNJ2O15056 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
SYNJ2O15056 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
SYNJ2O15056 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
SYNJ2O15056 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
SYNJ2O15056 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
SYNJ2O15056 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
SYNJ2O15056 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
SYNJ2O15056 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
SYNJ2O15056 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
SYNJ2O15056 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
SYNJ2O15056 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
SYNJ2O15056 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
SYNJ2O15056 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
SYNJ2O15056 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
SYNJ2O15056 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
SYNJ2O15056 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
SYNJ2O15056 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC37.29■■■■□ 3.56
SYNJ2O15056 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
SYNJ2O15056 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
SYNJ2O15056 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC37.29■■■■□ 3.56
SYNJ2O15056 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
SYNJ2O15056 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SYNJ2O15056 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SYNJ2O15056 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
SYNJ2O15056 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SYNJ2O15056 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SYNJ2O15056 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
SYNJ2O15056 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
SYNJ2O15056 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
SYNJ2O15056 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
SYNJ2O15056 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
SYNJ2O15056 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
SYNJ2O15056 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
SYNJ2O15056 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
SYNJ2O15056 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
SYNJ2O15056 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
SYNJ2O15056 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
SYNJ2O15056 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
SYNJ2O15056 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
SYNJ2O15056 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
SYNJ2O15056 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
SYNJ2O15056 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
SYNJ2O15056 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
SYNJ2O15056 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
SYNJ2O15056 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
SYNJ2O15056 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
SYNJ2O15056 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
SYNJ2O15056 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
SYNJ2O15056 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
SYNJ2O15056 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
SYNJ2O15056 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
SYNJ2O15056 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
SYNJ2O15056 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
SYNJ2O15056 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
SYNJ2O15056 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
SYNJ2O15056 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
SYNJ2O15056 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
SYNJ2O15056 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
SYNJ2O15056 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
SYNJ2O15056 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
SYNJ2O15056 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
SYNJ2O15056 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms