Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SETD1AO15047 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SETD1AO15047 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SETD1AO15047 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SETD1AO15047 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SETD1AO15047 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SETD1AO15047 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SETD1AO15047 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SETD1AO15047 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SETD1AO15047 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SETD1AO15047 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SETD1AO15047 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SETD1AO15047 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SETD1AO15047 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
SETD1AO15047 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
SETD1AO15047 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SETD1AO15047 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SETD1AO15047 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SETD1AO15047 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SETD1AO15047 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SETD1AO15047 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SETD1AO15047 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SETD1AO15047 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SETD1AO15047 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
SETD1AO15047 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SETD1AO15047 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SETD1AO15047 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SETD1AO15047 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SETD1AO15047 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SETD1AO15047 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SETD1AO15047 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
SETD1AO15047 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
SETD1AO15047 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SETD1AO15047 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SETD1AO15047 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SETD1AO15047 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SETD1AO15047 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SETD1AO15047 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SETD1AO15047 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SETD1AO15047 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SETD1AO15047 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
SETD1AO15047 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SETD1AO15047 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SETD1AO15047 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
SETD1AO15047 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SETD1AO15047 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms