Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3CDO00329 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3CDO00329 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PIK3CDO00329 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PIK3CDO00329 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms