Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NFKBIEO00221 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NFKBIEO00221 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NFKBIEO00221 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NFKBIEO00221 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NFKBIEO00221 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NFKBIEO00221 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NFKBIEO00221 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NFKBIEO00221 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NFKBIEO00221 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NFKBIEO00221 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NFKBIEO00221 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NFKBIEO00221 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NFKBIEO00221 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NFKBIEO00221 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NFKBIEO00221 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NFKBIEO00221 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NFKBIEO00221 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NFKBIEO00221 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NFKBIEO00221 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NFKBIEO00221 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NFKBIEO00221 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NFKBIEO00221 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NFKBIEO00221 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NFKBIEO00221 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NFKBIEO00221 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NFKBIEO00221 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NFKBIEO00221 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NFKBIEO00221 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NFKBIEO00221 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NFKBIEO00221 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NFKBIEO00221 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NFKBIEO00221 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NFKBIEO00221 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NFKBIEO00221 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NFKBIEO00221 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NFKBIEO00221 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NFKBIEO00221 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NFKBIEO00221 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NFKBIEO00221 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NFKBIEO00221 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NFKBIEO00221 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms