Protein–RNA interactions for Protein: H3BSU7

TMX2-CTNND1, TMX2-CTNND1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX2-CTNND1H3BSU7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMX2-CTNND1H3BSU7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms