Protein–RNA interactions for Protein: H3BNC9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNC9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BNC9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BNC9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BNC9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BNC9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BNC9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BNC9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BNC9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BNC9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BNC9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BNC9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BNC9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BNC9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BNC9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BNC9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BNC9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BNC9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H3BNC9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H3BNC9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H3BNC9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H3BNC9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H3BNC9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H3BNC9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H3BNC9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H3BNC9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H3BNC9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H3BNC9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
H3BNC9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H3BNC9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
H3BNC9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H3BNC9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H3BNC9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
H3BNC9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BNC9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BNC9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BNC9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BNC9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BNC9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BNC9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BNC9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BNC9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BNC9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BNC9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BNC9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BNC9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BNC9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BNC9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BNC9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BNC9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BNC9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BNC9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BNC9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BNC9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BNC9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BNC9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BNC9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BNC9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BNC9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BNC9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BNC9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BNC9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BNC9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BNC9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BNC9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BNC9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BNC9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BNC9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BNC9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BNC9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
H3BNC9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
H3BNC9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BNC9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BNC9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BNC9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BNC9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BNC9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BNC9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BNC9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BNC9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BNC9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BNC9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H3BNC9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H3BNC9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H3BNC9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
H3BNC9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H3BNC9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
H3BNC9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
H3BNC9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
H3BNC9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
H3BNC9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
H3BNC9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
H3BNC9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
H3BNC9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
H3BNC9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H3BNC9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H3BNC9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
H3BNC9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BNC9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BNC9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BNC9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms