Protein–RNA interactions for Protein: F8W031

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8W031 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
F8W031 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
F8W031 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
F8W031 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
F8W031 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
F8W031 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
F8W031 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
F8W031 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
F8W031 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
F8W031 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
F8W031 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
F8W031 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
F8W031 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
F8W031 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
F8W031 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
F8W031 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
F8W031 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
F8W031 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
F8W031 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
F8W031 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
F8W031 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
F8W031 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
F8W031 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
F8W031 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
F8W031 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
F8W031 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
F8W031 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
F8W031 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
F8W031 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
F8W031 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
F8W031 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
F8W031 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
F8W031 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
F8W031 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
F8W031 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
F8W031 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
F8W031 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
F8W031 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
F8W031 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
F8W031 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
F8W031 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
F8W031 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
F8W031 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
F8W031 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
F8W031 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
F8W031 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
F8W031 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
F8W031 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
F8W031 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
F8W031 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
F8W031 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
F8W031 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
F8W031 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
F8W031 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
F8W031 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
F8W031 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
F8W031 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
F8W031 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
F8W031 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
F8W031 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
F8W031 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
F8W031 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
F8W031 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
F8W031 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
F8W031 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
F8W031 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
F8W031 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
F8W031 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
F8W031 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
F8W031 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
F8W031 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
F8W031 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
F8W031 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
F8W031 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
F8W031 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
F8W031 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
F8W031 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
F8W031 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
F8W031 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
F8W031 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
F8W031 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
F8W031 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
F8W031 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
F8W031 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
F8W031 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
F8W031 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
F8W031 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
F8W031 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
F8W031 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
F8W031 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
F8W031 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
F8W031 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
F8W031 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
F8W031 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
F8W031 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
F8W031 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
F8W031 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
F8W031 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
F8W031 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
F8W031 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 792.2 ms