Protein–RNA interactions for Protein: F2Z398

LMO7DN, LMO7 downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7DNF2Z398 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMO7DNF2Z398 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMO7DNF2Z398 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMO7DNF2Z398 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMO7DNF2Z398 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMO7DNF2Z398 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMO7DNF2Z398 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMO7DNF2Z398 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMO7DNF2Z398 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMO7DNF2Z398 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMO7DNF2Z398 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMO7DNF2Z398 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMO7DNF2Z398 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMO7DNF2Z398 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMO7DNF2Z398 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMO7DNF2Z398 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMO7DNF2Z398 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMO7DNF2Z398 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMO7DNF2Z398 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMO7DNF2Z398 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMO7DNF2Z398 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMO7DNF2Z398 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMO7DNF2Z398 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMO7DNF2Z398 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMO7DNF2Z398 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMO7DNF2Z398 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMO7DNF2Z398 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMO7DNF2Z398 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMO7DNF2Z398 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMO7DNF2Z398 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LMO7DNF2Z398 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMO7DNF2Z398 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMO7DNF2Z398 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO7DNF2Z398 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO7DNF2Z398 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO7DNF2Z398 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO7DNF2Z398 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO7DNF2Z398 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO7DNF2Z398 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO7DNF2Z398 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO7DNF2Z398 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms