Protein–RNA interactions for Protein: E9PQ18

Putative short transient receptor potential channel 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PQ18 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E9PQ18 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E9PQ18 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E9PQ18 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E9PQ18 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E9PQ18 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E9PQ18 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E9PQ18 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E9PQ18 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E9PQ18 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E9PQ18 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E9PQ18 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E9PQ18 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
E9PQ18 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E9PQ18 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E9PQ18 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E9PQ18 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E9PQ18 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E9PQ18 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E9PQ18 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
E9PQ18 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E9PQ18 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E9PQ18 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E9PQ18 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E9PQ18 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E9PQ18 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E9PQ18 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E9PQ18 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E9PQ18 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E9PQ18 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E9PQ18 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E9PQ18 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E9PQ18 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E9PQ18 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E9PQ18 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
E9PQ18 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E9PQ18 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E9PQ18 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E9PQ18 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E9PQ18 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E9PQ18 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E9PQ18 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E9PQ18 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E9PQ18 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E9PQ18 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E9PQ18 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E9PQ18 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E9PQ18 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
E9PQ18 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E9PQ18 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E9PQ18 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E9PQ18 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E9PQ18 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E9PQ18 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E9PQ18 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E9PQ18 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E9PQ18 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E9PQ18 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E9PQ18 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E9PQ18 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E9PQ18 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
E9PQ18 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E9PQ18 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
E9PQ18 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E9PQ18 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
E9PQ18 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E9PQ18 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E9PQ18 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E9PQ18 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E9PQ18 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E9PQ18 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E9PQ18 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E9PQ18 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
E9PQ18 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E9PQ18 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E9PQ18 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E9PQ18 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E9PQ18 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E9PQ18 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E9PQ18 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E9PQ18 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E9PQ18 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E9PQ18 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E9PQ18 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E9PQ18 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E9PQ18 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E9PQ18 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E9PQ18 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E9PQ18 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E9PQ18 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
E9PQ18 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E9PQ18 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E9PQ18 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E9PQ18 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E9PQ18 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E9PQ18 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E9PQ18 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E9PQ18 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E9PQ18 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E9PQ18 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms