Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
E9PMD0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
E9PMD0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
E9PMD0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
E9PMD0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
E9PMD0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
E9PMD0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
E9PMD0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
E9PMD0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
E9PMD0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
E9PMD0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
E9PMD0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
E9PMD0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
E9PMD0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
E9PMD0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
E9PMD0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
E9PMD0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
E9PMD0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
E9PMD0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
E9PMD0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
E9PMD0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
E9PMD0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
E9PMD0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
E9PMD0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
E9PMD0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
E9PMD0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
E9PMD0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
E9PMD0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
E9PMD0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
E9PMD0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
E9PMD0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
E9PMD0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
E9PMD0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
E9PMD0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
E9PMD0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
E9PMD0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
E9PMD0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
E9PMD0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
E9PMD0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
E9PMD0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
E9PMD0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
E9PMD0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
E9PMD0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
E9PMD0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
E9PMD0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
E9PMD0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
E9PMD0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
E9PMD0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
E9PMD0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
E9PMD0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
E9PMD0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
E9PMD0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
E9PMD0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
E9PMD0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
E9PMD0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
E9PMD0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
E9PMD0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
E9PMD0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
E9PMD0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
E9PMD0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
E9PMD0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
E9PMD0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
E9PMD0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
E9PMD0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
E9PMD0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
E9PMD0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
E9PMD0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
E9PMD0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
E9PMD0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
E9PMD0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
E9PMD0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
E9PMD0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
E9PMD0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
E9PMD0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
E9PMD0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
E9PMD0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
E9PMD0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
E9PMD0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
E9PMD0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
E9PMD0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
E9PMD0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
E9PMD0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
E9PMD0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
E9PMD0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
E9PMD0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
E9PMD0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
E9PMD0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
E9PMD0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
E9PMD0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
E9PMD0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
E9PMD0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
E9PMD0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
E9PMD0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
E9PMD0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
E9PMD0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
E9PMD0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
E9PMD0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
E9PMD0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
E9PMD0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
E9PMD0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms